Музей природы Костромской области был создан в 1958 году как отдел Костромского историко-архитектурного музея-заповедника. Первоначально размещался в Ипатьевском монастыре. Экспозиция пострадала от пожара и была восстановлена только в 1965 году. В 2002 году музей был переведён в центр города и занял исторические здания коммерческой биржи и чайной Общества трезвости и примыкающих к нему Шорных рядов. Экспонаты музея знакомят с миром природы Костромской области, одной из самых протяжённых и разнообразных по ландшафтам и биотопам.