Церковь Рождества Иоанна Предтечи была собором Ивановского монастыря, известного с 1276 года. Существующая каменная церковь построена в 1695 году. Долгое время Иоанновский собор был главным собором Старой Ладоги. В 1920-х годах был закрыт. В 1991 году завершена реставрация и собор возвращён верующим.