Тёплая церковь Троицы была построена в 1821 году рядом с Воскресенским собором, на месте, где были некогда похоронены инокини Евдокия и Александра. Евдокия - основательница монастыря, в миру княгиня Ефросинья Старицкая, была заточена в монастырь в 1563 году по обвинению "в неправде". Вместе с ней в монастыре жила под именем Александра Иулиания Палецкая, жена угличского князя Юрия Васильевича, брата царя Ивана IV. В 1579 году их обеих и ещё нескольких монахинь убили по царскому приказу, согласно горицкой рукописи опричники утопили их в Шексне. Останки узниц были погребены в деревянной часовне, на месте которой построена Троицкая церковь. В 2007 году найдены были останки двух женщин, предположительно Ефросиньи и Иулиании. В церкви стоит рака с мощами. Троицкая церковь представляет собой квадратный в плане четверик, увенчанный куполом, к которому с восточной и западной стороны примыкают одинаковые полукружия. С северной и южной сторон пристроены колонные портики.