По преданию, деревянный храм Николая Чудотворца был построен на берегу Которосли в рубленом городе еще при Ярославе Мудром. Существующая каменная бесстолпная церковь трапезного типа, одна из немногих сохранившихся от ярославского кремля, построена на средства посадских людей, владевших близлежащими верфями, в 1695 году.