Располагается позади главного здания Академии наук. Строительство его началось в 1826г., в то же время, когда на месте разобранного бывшего дворца Прасковьи Федоровны начали строить южный пакгауз Биржи. "Музейный флигель" строился по проекту И.Ф.Лукини и был завершен в 1831г. Предназначался для академической типографии и коллекций "академического музеума", ранее находившихся во дворце Прасковьи Федоровны. Двухэтажный, с третьим антресольным этажом П-образный в плане корпус ограничивает с трех сторон двор Академии наук. Внутренние углы здания отмечены невысокими куполами, перекрывающими круглые залы. Фасады решены по образцу Новобиржевого гостиного двора. В первом этаже - полуциркулярные окна, во втором - прямоугольные окна, обрамленные полуциркулярными наличниками. В здании применены цилиндрические и зеркальные своды. В залах второго этажа сохранились лепные карнизы. Постройка "Музейного флигеля" и пакгаузов Биржи сформировала большую площадь между зданиями "Двенадцати коллегий" и Биржей.