Научно-исследовательское судно "Витязь" - первый и главный экспонат музея. С его установки на вечную стояну в 1994 году началось создание экспозиции Набережной исторического флота. Это двухпалубный грузо-пассажирский теплоход, построенный в 1939 году в Германии, на верфи "Шихау" в Бремерхафене и получивший название "Марс". Во время Второй мировой войны судно использовалось немцами как военное транспортное, а после победы было передано Великобритании в качестве репарации. Через год оно было передано СССР. В 1947-1949 годах судно было перепрофилировано в научно-исследовательский корабль Академии Наук СССР и получило нынешнее название "Витязь". С 1949 по 1979 год "Витязь" совершил 65 научных рейсов протяженностью около 800 000 миль, на нем работали ученые 50 отечественных институтов и 20 зарубежных стран, сформировалась школа советской океанологии. С борта "Витязя" была измерена максимальная глубина Марианской впадины, сделано много других открытий. Послдений рейс в 1979 г. судно завершило в Калиниграде, где через 11 лет было отреставрировано, поставлено на вечную стоянку и превращено в музей.